Akutní forma průjmu by se dala také pojmenovat jako snaha o odstranění jedů a patogenů s organismu. Defakto se jedná o samoléčení vyvolané otravou či infekcí a proto jeho průběh kontrolujeme pouze systémovými opatřeními. Podstatnou součástí je nahrazování dostatku tekutin, aby nedošlo k dehydrataci. V průměru mluvíme o alespoň čtyřech litrech tekutin dodaných hořkým čajem, neperlivými minerálkami či iontovými nápoji. S čajů jsou doporučovány např. listy maliníku a ostružiníku, které působí na střevní sliznici, čímž zadržují tekutiny. Během prvního dne potíží by jsme se měli zaměřit pouze na předcházení dehydratace doplňováním tekutin, suché pečivo nebo piškoty, by měli do jídelníčku být zařazeny až následující den. Krom pečiva je vhodné postupně zařazovat do jídelníčku dobře stravitelné potraviny. Osvědčená je rýže, pro vysoký obsah draslíku banány, mrkvový odvar, brambory, zeleninové polévky a bílé jogurty obsahující laktobacily. Při silných průjmech u rizikových skupin se o správný přísun vody, minerálů a iontů starají speciálně namíchané rehydratační roztoky. Pomoci svému tělu v boji s infekcí můžete podáním léků určených k desinfekci střev (Endiaron) a v případě otrav, medikamenty chránicí sliznici (živočišné uhlí). Lékař poté může ještě předepsat antidiarotika, která snižují pohyblivost střev. Antibiotika jsou povětšinou předepisována jen při závažných komplikacích a u kojenců.
V případě dlouhodobějšího trvání průjmu je naprosto nezbytné navštívit svého lékaře. Ten na základě vyšetření může určit přesnou příčinu obtíží a předejít tak vážným komplikacím. Součástí diagnostiky krom běžné anamnézy pravděpodobně bude výtěr z konečníku pro laboratorní vyšetření na přítomnost bakterií a parazitů. Nadále je prováděn test na okultní krvácení, jímž se dá odhalit skryté krvácení. Na základě výsledku testu budete odesláni na kolonoskopické nebo irigoskopické vyšetření, jimiž lze odhalit jakoukoliv odchylku na sliznici střeva. Následná léčba se poté zaměřuje na onemocnění průjem vyvolávající. Dle činitele se může jednat o medikamentní léčbu nebo také operativní odstranění poškozené oblasti.